Conforme o regulamento aprovado pelos clubes antes do início da Copa Prata, ficou definido que a segunda fase seria sorteio dos confrontos e que não teria classificação geral, pois o grupo A teria um time a menos que os grupos B e C. 

Definido os confrontos da segunda fase, com a forma de dipusta: partida única e em caso de empate a decisão será no pênaltis.